Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3CQ15386 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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