Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB35Q15286 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB35Q15286 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms