Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAM2Q15035 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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