Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERC3Q15034 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERC3Q15034 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms