Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
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