Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSPNQ14714 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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