Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SQLEQ14534 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SQLEQ14534 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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