Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPARCL1Q14515 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPARCL1Q14515 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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