Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL9A2Q14055 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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