Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL4A6Q14031 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COL4A6Q14031 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL4A6Q14031 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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