Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CIRBPQ14011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms