Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2AQ13885 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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