Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SHROOM2Q13796 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
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SHROOM2Q13796 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
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SHROOM2Q13796 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
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SHROOM2Q13796 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
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SHROOM2Q13796 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SHROOM2Q13796 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SHROOM2Q13796 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
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