Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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