Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEUROD1Q13562 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEUROD1Q13562 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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