Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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