Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1AQ13111 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1AQ13111 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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