Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.096e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.196e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.226e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.226e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.236e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.36e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.356e-16■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.46e-16■■■■□ 20.1
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ILF3Q12906 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-8■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 53.93□□□□□ -1.782e-8■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 SLC44A5-203ENST00000469525 721 ntTSL 56.62□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 530.22■■■□□ 2.433e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.073e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.893e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 516.32■□□□□ 0.23e-14■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GTF2H3-211ENST00000543154 582 ntTSL 28.42□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GTF2H3-202ENST00000536375 790 ntTSL 55.29□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 20.1
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ILF3Q12906 GTF2H3-209ENST00000542279 552 ntTSL 53.23□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 331.99■■■□□ 2.713e-12■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 322.94■■□□□ 1.263e-12■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.353e-12■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 510.81□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CEACAM1-204ENST00000358394 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 20.1
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ILF3Q12906 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.434e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.574e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 CEACAM1-211ENST00000485605 678 ntTSL 55.19□□□□□ -1.584e-6■■■■□ 20.1
ILF3Q12906 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.899e-7■■■■□ 20
ILF3Q12906 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.619e-7■■■■□ 20
ILF3Q12906 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.559e-7■■■■□ 20
ILF3Q12906 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 310.19□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 20
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ILF3Q12906 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-8■■■■□ 20
ILF3Q12906 TTC7B-202ENST00000553948 630 ntTSL 532.22■■■□□ 2.755e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 322.08■■□□□ 1.135e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CERS5-218ENST00000549942 522 ntTSL 421.63■■□□□ 1.055e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CERS5-222ENST00000550899 578 ntTSL 420.17■□□□□ 0.825e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 CERS5-210ENST00000547455 565 ntTSL 418.9■□□□□ 0.625e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 CERS5-217ENST00000549389 558 ntTSL 417.81■□□□□ 0.445e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 KSR1-217ENST00000583370 1041 ntTSL 317.18■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CERS5-220ENST00000550258 579 ntTSL 417.1■□□□□ 0.335e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CERS5-212ENST00000547800 825 ntTSL 216.91■□□□□ 0.35e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.35e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt16.2■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.165e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 05e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 GTF2F1-202ENST00000593678 1705 ntTSL 214.47□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 KSR1-215ENST00000582311 693 ntTSL 214.19□□□□□ -0.145e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 513.64□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-212ENST00000600373 709 ntTSL 213.6□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-206ENST00000596554 727 ntTSL 313□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 20
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