Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-223ENST00000620808 773 ntTSL 522.5■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-220ENST00000615986 1900 ntTSL 221.98■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-217ENST00000613634 1109 ntTSL 521.82■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-219ENST00000615658 1322 ntTSL 221.29■■□□□ 13e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-214ENST00000612012 877 ntTSL 520.88■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-202ENST00000426231 864 ntTSL 516.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 TAZ-203ENST00000439735 567 ntTSL 510.21□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 DVL2-208ENST00000575086 900 ntTSL 320.06■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 DVL2-213ENST00000576840 941 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 LPIN3-202ENST00000445975 808 ntTSL 512.16□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 LPIN3-204ENST00000496565 568 ntTSL 39.07□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 FKBP11-207ENST00000549084 517 ntTSL 37.5□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 PRSS53-202ENST00000486499 5489 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 516.31■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 30.8
SF3A3Q12874 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 GRINA-209ENST00000533377 627 ntTSL 213.53□□□□□ -0.247e-17■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 GRINA-204ENST00000527194 806 ntTSL 213.27□□□□□ -0.297e-17■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-8■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.51□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 30.7
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SF3A3Q12874 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 HAAO-203ENST00000402698 1522 ntTSL 516.53■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-10■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 514.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 HAAO-204ENST00000404451 651 ntTSL 313.34□□□□□ -0.274e-10■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 512.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CCDC57-211ENST00000578187 696 ntTSL 211.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ZNF335-202ENST00000475002 1721 ntTSL 218.71■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 DDX11-214ENST00000539673 652 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-207ENST00000551594 900 ntTSL 317.51■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-206ENST00000550144 544 ntTSL 411.23□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 210.26□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 30.7
SF3A3Q12874 ROGDI-206ENST00000586504 651 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 TJAP1-211ENST00000459851 480 ntTSL 315.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 TJAP1-212ENST00000478173 666 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 30.6
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SF3A3Q12874 GCLC-206ENST00000509541 3774 ntTSL 59.35□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)4.25□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 LENG8-205ENST00000439657 1073 ntTSL 512.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 11e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 ASB1-203ENST00000438264 1048 ntTSL 316.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 ASB1-209ENST00000491653 818 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 ASB1-204ENST00000463352 569 ntTSL 310.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 30.6
SF3A3Q12874 INPPL1-203ENST00000535985 353 ntTSL 211.12□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 ENOSF1-213ENST00000581928 443 ntTSL 210.73□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 520.25■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 NFKBID-208ENST00000590828 1552 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-206ENST00000432295 1156 ntTSL 515.62■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 NCAPH2-210ENST00000523045 970 ntTSL 514.04□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 TKFC-203ENST00000524953 575 ntTSL 210.59□□□□□ -0.718e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.767e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.917e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.937e-10■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 TKFC-220ENST00000534134 585 ntTSL 38.61□□□□□ -1.038e-8■■■■■ 30.5
SF3A3Q12874 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 30.5
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