Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STX4Q12846 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
STX4Q12846 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STX4Q12846 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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