Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	ATG5	YPL149W	885 nt		0.57	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	SHU2	YDR078C	672 nt		0.56	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	PUS9	YDL036C	1389 nt		0.56	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	CSE1	YGL238W	2883 nt		0.56	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	HLR1	YDR528W	1272 nt		0.55	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	CUP9	YPL177C	921 nt		0.55	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	BIT61	YJL058C	1632 nt		0.55	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	YPL035C	YPL035C	348 nt		0.55	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	YLR149C	YLR149C	2193 nt		0.55	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	RIM20	YOR275C	1986 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	ESA1	YOR244W	1338 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	CDC10	YCR002C	969 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	RIF2	YLR453C	1188 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	MED11	YMR112C	396 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	BAG7	YOR134W	1230 nt		0.54	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	BEM3	YPL115C	3387 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	PAF1	YBR279W	1338 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	LYS14	YDR034C	2373 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	FUS1	YCL027W	1539 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	MTC7	YEL033W	420 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	CKA1	YIL035C	1119 nt		0.53	□□□□□ -2.32
SMC4	Q12267	MNE1	YOR350C	1992 nt		0.53	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	RNH202	YDR279W	1053 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	HYR1	YIR037W	492 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	NYV1	YLR093C	762 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	UFE1	YOR075W	1041 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	NSL1	YPL233W	651 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	SPP381	YBR152W	876 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	RLM1	YPL089C	2031 nt		0.52	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	TRM12	YML005W	1389 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	TEN1	YLR010C	483 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	TOA1	YOR194C	861 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	CAF20	YOR276W	486 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YPR063C	YPR063C	423 nt		0.51	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	SEC8	YPR055W	3198 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	SRN2	YLR119W	642 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	ASM4	YDL088C	1587 nt		0.5	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	PRK1	YIL095W	2433 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	AEP3	YPL005W	1821 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	LRS4	YDR439W	1044 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YLR400W	YLR400W	474 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	PEX27	YOR193W	1131 nt		0.49	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	SLY1	YDR189W	2001 nt		0.48	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YCR108C	YCR108C	192 nt		0.48	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	NSE4	YDL105W	1209 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	MON1	YGL124C	1935 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	NCA2	YPR155C	1851 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	SNA4	YDL123W	423 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YAP3	YHL009C	993 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	EPT1	YHR123W	1176 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	YBR063C	YBR063C	1215 nt		0.47	□□□□□ -2.33
SMC4	Q12267	HSE1	YHL002W	1359 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	KAR9	YPL269W	1935 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	GLC7	YER133W	939 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YKL177W	YKL177W	339 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	RPL6B	YLR448W	531 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	GIM3	YNL153C	390 nt		0.46	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	NNF2	YGR089W	2811 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	CLG1	YGL215W	1359 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YMR31	YFR049W	372 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YJL022W	YJL022W	309 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YPR159C-A	YPR159C-A	102 nt		0.45	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YDR248C	YDR248C	582 nt		0.44	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	ATG38	YLR211C	681 nt		0.44	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YMR181C	YMR181C	465 nt		0.44	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	COX1	Q0045	1605 nt		0.44	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	ALK1	YGL021W	2283 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	HAL9	YOL089C	3093 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	HOP2	YGL033W	657 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	SEC22	YLR268W	645 nt		0.43	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	PRM6	YML047C	1059 nt		0.42	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	CTL1	YMR180C	963 nt		0.42	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	MVP1	YMR004W	1536 nt		0.42	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	CLB5	YPR120C	1308 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YGR190C	YGR190C	366 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	SAY1	YGR263C	1275 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YLR444C	YLR444C	303 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YPR014C	YPR014C	330 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	WHI3	YNL197C	1986 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	POL4	YCR014C	1749 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YSW1	YBR148W	1830 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	AZF1	YOR113W	2745 nt		0.41	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	YDR355C	YDR355C	303 nt		0.4	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	RGI1	YER067W	486 nt		0.4	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	SNC1	YAL030W	354 nt		0.4	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	IRC19	YLL033W	693 nt		0.4	□□□□□ -2.34
SMC4	Q12267	CRM1	YGR218W	3255 nt		0.4	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	ARK1	YNL020C	1917 nt		0.4	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	IES5	YER092W	378 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	YER189W	YER189W	369 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	BTN2	YGR142W	1233 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	MMF1	YIL051C	438 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	VPS55	YJR044C	423 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	CMC2	YBL059C-A	330 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	CDC5	YMR001C	2118 nt		0.39	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	YEA4	YEL004W	1029 nt		0.38	□□□□□ -2.35
SMC4	Q12267	ULI1	YFR026C	510 nt		0.38	□□□□□ -2.35

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