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Protein–RNA interactions for Protein: Q12254
SVS1, Protein SVS1, yeast
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260 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SVS1
Q12254
REV1
YOR346W
2958 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
SSM4
YIL030C
3960 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
FLO5
YHR211W
3228 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
MSS11
YMR164C
2277 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
YDL062W
YDL062W
426 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
ATP8
Q0080
147 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
YAL059C-A
YAL059C-A
423 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
RPS18B
YML026C
441 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
ESF2
YNR054C
951 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
SWD3
YBR175W
948 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
RPN2
YIL075C
2838 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
TFB1
YDR311W
1929 nt
3.3
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
RPA190
YOR341W
4995 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
YFH1
YDL120W
525 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
FAP7
YDL166C
594 nt
3.29
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
VBA4
YDR119W
2307 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
BMS1
YPL217C
3552 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
CDC24
YAL041W
2565 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
tF(GAA)D
tF(GAA)D
73 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
tF(GAA)N
tF(GAA)N
73 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
YJL020W-A
YJL020W-A
258 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
HSK3
YKL138C-A
210 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
YKR033C
YKR033C
426 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
AIM9
YER080W
1884 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
ECM5
YMR176W
4236 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
NSP1
YJL041W
2472 nt
3.28
□□□□□ -1.88
SVS1
Q12254
SIP3
YNL257C
3690 nt
3.28
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
STE23
YLR389C
3084 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YGR151C
YGR151C
336 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
MF(ALPHA)1
YPL187W
498 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RAD5
YLR032W
3510 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
XRN1
YGL173C
4587 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
NOP4
YPL043W
2058 nt
3.27
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
HCS1
YKL017C
2052 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YJL181W
YJL181W
1836 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
BRO1
YPL084W
2535 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YMR317W
YMR317W
3423 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
GYP7
YDL234C
2241 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
FAS1
YKL182W
6156 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
APC9
YLR102C
798 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
HTB2
YBL002W
396 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YOR008C-A
YOR008C-A
225 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RPL36B
YPL249C-A
303 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
NPR1
YNL183C
2373 nt
3.26
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
NTO1
YPR031W
2247 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
REG1
YDR028C
3045 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RAD61
YDR014W
1944 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YLL032C
YLL032C
2478 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YDR048C
YDR048C
315 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
LEU3
YLR451W
2661 nt
3.25
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
STT4
YLR305C
5703 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
SET1
YHR119W
3243 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
APC11
YDL008W
498 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
snR79
snR79
84 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
MYO3
YKL129C
3819 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
CCW14
YLR390W-A
717 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
IES4
YOR189W
351 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
GCN1
YGL195W
8019 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
DBP6
YNR038W
1890 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
PKH1
YDR490C
2301 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
PEX1
YKL197C
3132 nt
3.24
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RPS17B
YDR447C
411 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YTA7
YGR270W
4140 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RPL32
YBL092W
393 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YBR064W
YBR064W
429 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
SMC3
YJL074C
3693 nt
3.23
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
MSH2
YOL090W
2895 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
POL3
YDL102W
3294 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
VPS64
YDR200C
1815 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YIL102C
YIL102C
306 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
RPA34
YJL148W
702 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
LCL2
YLR104W
396 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
YOR011W-A
YOR011W-A
207 nt
3.22
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
FLO9
YAL063C
3969 nt
3.21
□□□□□ -1.89
SVS1
Q12254
MET10
YFR030W
3108 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
FUS1
YCL027W
1539 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YER121W
YER121W
345 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
TRM7
YBR061C
933 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
MYO5
YMR109W
3660 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
CIN8
YEL061C
3003 nt
3.21
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
SQS1
YNL224C
2304 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
DOA4
YDR069C
2781 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
COG3
YER157W
2406 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YMR31
YFR049W
372 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YGL239C
YGL239C
315 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
RPS23A
YGR118W
438 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
TIM13
YGR181W
318 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YPR146C
YPR146C
330 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
VPS3
YDR495C
3036 nt
3.2
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
COG8
YML071C
1824 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
CHO2
YGR157W
2610 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YLR012C
YLR012C
300 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
TCP1
YDR212W
1680 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
SKT5
YBL061C
2091 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
ECM25
YJL201W
1800 nt
3.19
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
SSE1
YPL106C
2082 nt
3.18
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
YDL007C-A
YDL007C-A
258 nt
3.18
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
GIS2
YNL255C
462 nt
3.18
□□□□□ -1.9
SVS1
Q12254
SNT1
YCR033W
3681 nt
3.17
□□□□□ -1.9
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