Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YGR018CYGR018C 330 nt2.18□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YLR031WYLR031W 561 nt2.18□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 RMP1YLR145W 606 nt2.18□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.18□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 NUP82YJL061W 2142 nt2.18□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 MPH1YIR002C 2982 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 RAV1YJR033C 4074 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 TAE2YPL009C 3117 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 COX13YGL191W 390 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 RPS17AYML024W 411 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 DDR48YMR173W 1293 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YNL010WYNL010W 726 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 DAD3YBR233W-A 285 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 SKP2YNL311C 2292 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 FKS3YMR306W 5358 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 UBR1YGR184C 5853 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 PDR1YGL013C 3207 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 MLH1YMR167W 2310 nt2.17□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 SGS1YMR190C 4344 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 STH1YIL126W 4080 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 MZM1YDR493W 372 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 RPC10YHR143W-A 213 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 NCE101YJL205C 162 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YKR051WYKR051W 1257 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 PRE8YML092C 753 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 SEN15YMR059W 387 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YPL276WYPL276W 438 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 SLM6YBR266C 453 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.16□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 YJL016WYJL016W 1686 nt2.15□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 IPT1YDR072C 1584 nt2.15□□□□□ -2.06
VAM3Q12241 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 BET3YKR068C 582 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 VPS20YMR077C 666 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 VTI1YMR197C 654 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOR055WYOR055W 435 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 ROX1YPR065W 1107 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SVL3YPL032C 2478 nt2.15□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 CDC50YCR094W 1176 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RPF1YHR088W 888 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RPI1YIL119C 1224 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 AYR1YIL124W 894 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 IRC19YLL033W 693 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 GRX8YLR364W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SAS2YMR127C 1017 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SIP18YMR175W 240 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOR050CYOR050C 348 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 BFA1YJR053W 1725 nt2.14□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 VOA1YGR106C 798 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 NOP10YHR072W-A 177 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SNC1YAL030W 354 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 UTP30YKR060W 825 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YLR171WYLR171W 390 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 ASM4YDL088C 1587 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 GIP3YPL137C 3831 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 AFI1YOR129C 2682 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOL098CYOL098C 3114 nt2.13□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RSE1YML049C 4086 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 BI2Q0110 1272 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 MSL1YIR009W 336 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YML108WYML108W 318 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RSA1YPL193W 1146 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 PTP3YER075C 2787 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RNH70YGR276C 1662 nt2.12□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SMD1YGR074W 441 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 UBP15YMR304W 3693 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 CDC53YDL132W 2448 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 NEW1YPL226W 3591 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 CLN3YAL040C 1743 nt2.11□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SEC16YPL085W 6588 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 KAP123YER110C 3342 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YCR001WYCR001W 315 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 SYM1YLR251W 594 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 PEX17YNL214W 600 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YOR248WYOR248W 303 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 VPS52YDR484W 1926 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YPR097WYPR097W 3222 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 PDR11YIL013C 4236 nt2.1□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 snR70snR70 164 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YDL041WYDL041W 354 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 EMC6YLL014W 327 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 YMR324CYMR324C 243 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 RPB5YBR154C 648 nt2.09□□□□□ -2.07
VAM3Q12241 VMA9YCL005W-A 222 nt2.09□□□□□ -2.07
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