Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms