Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP4Q09028 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms