Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACSM1Q08AH1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM1Q08AH1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms