Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms