Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms