Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms