Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms