Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms