Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL6Q02878 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms