Protein–RNA interactions for Protein: Q02863

UBP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP16Q02863 BOI1YBL085W 2943 nt2.83□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 NUP170YBL079W 4509 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 NOP19YGR251W 591 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 PEP8YJL053W 1140 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 ATP7YKL016C 525 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 EXO84YBR102C 2262 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 GCD10YNL062C 1437 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SEN54YPL083C 1404 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 POM152YMR129W 4014 nt2.82□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 INP53YOR109W 3324 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 DBP7YKR024C 2229 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 FYV4YHR059W 393 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RPC10YHR143W-A 213 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RPL40BYKR094C 387 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YLR255CYLR255C 354 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RPS7BYNL096C 573 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SWM2YNR004W 441 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 PEP12YOR036W 867 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 MSL5YLR116W 1431 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 MED1YPR070W 1701 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 COG3YER157W 2406 nt2.81□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 MKT1YNL085W 2493 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RIX1YHR197W 2292 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 DIE2YGR227W 1578 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 FUS1YCL027W 1539 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RPS24AYER074W 408 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YOR121CYOR121C 306 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 PDR11YIL013C 4236 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 UBP15YMR304W 3693 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 RPS17BYDR447C 411 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YGR035CYGR035C 351 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 PET191YJR034W 327 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YNL034WYNL034W 1839 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 NDD1YOR372C 1665 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 DUF1YOL087C 3351 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SNQ2YDR011W 4506 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SAP1YER047C 2694 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YSW1YBR148W 1830 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SPO71YDR104C 3738 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 LEU3YLR451W 2661 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP16Q02863 SPC72YAL047C 1869 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 MRD1YPR112C 2664 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YIL058WYIL058W 285 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 UNG1YML021C 1080 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 FPR1YNL135C 345 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 ESF2YNR054C 951 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YOR146WYOR146W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 ECM5YMR176W 4236 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 RLF2YPR018W 1821 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 SAP190YKR028W 3102 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YOL057WYOL057W 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 PUF6YDR496C 1971 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 TIM8YJR135W-A 264 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 SPB1YCL054W 2526 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 MOT1YPL082C 5604 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 APC2YLR127C 2562 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 RCY1YJL204C 2523 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 REV3YPL167C 4515 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YDL068WYDL068W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 BAT1YHR208W 1182 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 AIM32YML050W 936 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YOR199WYOR199W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YAT2YER024W 2772 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 KAP104YBR017C 2757 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YKL136WYKL136W 399 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 CGI121YML036W 546 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 RRM3YHR031C 2172 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 BNA4YBL098W 1383 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 SNX41YDR425W 1878 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YIL166CYIL166C 1629 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 BRP1YGL007W 378 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 RPS1AYLR441C 768 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 ECM25YJL201W 1800 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 YJR098CYJR098C 1971 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 DSE4YNR067C 3354 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 ADK1YDR226W 669 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 TIM11YDR322C-A 291 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 RPL27BYDR471W 411 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 KAP123YER110C 3342 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 AI2Q0055 2565 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 TRM2YKR056W 1920 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 SCD5YOR329C 2619 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP16Q02863 GPI8YDR331W 1236 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 YOR105WYOR105W 327 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 BRO1YPL084W 2535 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP16Q02863 HYR1YIR037W 492 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.3 ms