Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNC1Q01954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNC1Q01954 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms