Protein–RNA interactions for Protein: Q01658

DR1, Protein Dr1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DR1Q01658 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DR1Q01658 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DR1Q01658 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DR1Q01658 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DR1Q01658 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DR1Q01658 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DR1Q01658 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms