Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms