Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SIM1P81133 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIM1P81133 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIM1P81133 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIM1P81133 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIM1P81133 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIM1P81133 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms