Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO1P63165 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms