Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPL23P62829 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL23P62829 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPL23P62829 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms