Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms