Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP10-11P60412 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms