Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAV3P56539 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CAV3P56539 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAV3P56539 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAV3P56539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAV3P56539 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CAV3P56539 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV3P56539 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV3P56539 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV3P56539 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms