Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP3P54108 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms