Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LBX1P52954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LBX1P52954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LBX1P52954 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LBX1P52954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LBX1P52954 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LBX1P52954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LBX1P52954 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBX1P52954 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBX1P52954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LBX1P52954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBX1P52954 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LBX1P52954 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms