Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LUMP51884 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LUMP51884 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LUMP51884 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LUMP51884 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LUMP51884 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LUMP51884 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LUMP51884 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LUMP51884 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LUMP51884 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms