Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RORCP51449 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RORCP51449 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RORCP51449 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RORCP51449 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RORCP51449 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RORCP51449 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms