Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms