Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LHX1P48742 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LHX1P48742 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LHX1P48742 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms