Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LSSP48449 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LSSP48449 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LSSP48449 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LSSP48449 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LSSP48449 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LSSP48449 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LSSP48449 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSSP48449 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSSP48449 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSSP48449 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LSSP48449 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LSSP48449 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms