Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RXRGP48443 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RXRGP48443 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RXRGP48443 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RXRGP48443 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RXRGP48443 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RXRGP48443 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms